Viele Verbindungen werden durch Kristallisation aus einer wässrigen Lösung gereinigt. Der Kristall schließt viele Verunreinigungen aus, jedoch kann Wasser in das Kristallgitter passen, ohne chemisch an das Kation der Verbindung gebunden zu sein. Das Anwenden von Wärme kann dieses Wasser vertreiben, aber der Prozess beschädigt typischerweise die Kristallstruktur. Dies ist in Ordnung, wenn das Ziel darin besteht, eine reine Verbindung zu erhalten. Es kann unerwünscht sein, wenn Kristalle für die Kristallographie oder andere Zwecke gezüchtet werden.
Manchmal werden die beiden Formen kombiniert. Zum Beispiel [Cu (H.2Ö)4]SO4· H.2O kann verwendet werden, um das Kristallwasser von Kupfer (II) sulfat zu beschreiben.
Wasser ist ein kleines polares Molekül, das leicht in Kristallgitter eingebaut werden kann, aber es ist nicht das einzige Lösungsmittel, das in Kristallen vorkommt. Tatsächlich verbleiben die meisten Lösungsmittel mehr oder weniger im Kristall. Ein häufiges Beispiel ist Benzol. Um die Wirkung eines Lösungsmittels zu minimieren, versuchen Chemiker normalerweise, durch Vakuumextraktion so viel wie möglich zu entfernen, und können eine Probe erwärmen, um restliches Lösungsmittel auszutreiben. Röntgenkristallographie kann häufig Lösungsmittel in einem Kristall nachweisen.