Bei den Wahlen von 1800 gab es keine „offiziellen“ Vizepräsidentschaftskandidaten. Gemäß der US-Verfassung haben die Wähler zwei Entscheidungen für den Präsidenten getroffen, und wer die meisten Stimmen erhielt, wurde Präsident. Die Person mit den zweitmeisten Stimmen wurde Vizepräsident. Dies würde sich mit der Verabschiedung der 12. Änderung ändern.
Obwohl es keinen offiziellen Vizepräsidentschaftskandidaten gab, lief Thomas Jefferson mit Aaron Burr als seinem Laufkameraden. Ihr „Ticket“ erhielt die meisten Stimmen und die Entscheidung, wer Präsident werden würde, wurde den Wählern gegeben. John Adams wurde entweder mit Pinckney oder Jay gepaart. Nach Angaben des Nationalarchivs wurde jedoch keine offizielle Aufzeichnung über die Anzahl der Volksstimmen geführt.
Zwischen Thomas Jefferson und Aaron Burr gab es eine Wahlstimme mit jeweils 73 Stimmen. Aus diesem Grund musste das Repräsentantenhaus entscheiden, wer Präsident und wer Vizepräsident sein würde. Aufgrund einer intensiven Kampagne von
Alexander HamiltonThomas Jefferson wurde nach 35 Stimmzetteln vor Aaron Burr ausgewählt. Hamiltons Aktionen waren ein Faktor, der 1804 zu seinem Tod in einem Duell mit Burr führte.