Das Ergebnis der Schlacht war nicht schlüssig, aber der Norden gewann einen strategischen Vorteil. 23.100 Opfer.
Am 16. September wurde Generalmajor George B. McClellan traf General Robert E. Lees Armee von Nord-Virginia in Sharpsburg, Maryland. Am nächsten Morgen im Morgengrauen führte der Generalmajor der Union, Joseph Hooker, sein Korps zu einem starken Angriff auf Lees linke Flanke. Dies begann an dem blutigsten Tag in der gesamten amerikanischen Militärgeschichte. Es kam zu Kämpfen über ein Getreidefeld und um die Dunker Church. Außerdem griffen Unionstruppen die Konföderierten an der versunkenen Straße an, die tatsächlich das Zentrum der Konföderierten durchbohrte. Die nördlichen Truppen haben diesen Vorteil jedoch nicht genutzt. Später gerieten die Truppen von Union General Ambrose Burnside in den Kampf, krümmten sich über Antietam Creek und erreichten die rechte Seite der Konföderierten.
In einem entscheidenden Moment kam der Generalkonföderierte Ambrose Powell Hill, Jr.s Division, aus
Harpers Ferry und Gegenangriff. Er konnte Burnside zurückfahren und den Tag retten. Obwohl er zwei zu eins zahlenmäßig unterlegen war, beschloss Lee, seine gesamte Armee zu verpflichten, während der Generalmajor der Union, George B. McClellan schickte weniger als drei Viertel seiner Armee, was Lee ermöglichte, die Federals zum Stillstand zu bringen. Beide Armeen konnten ihre Linien während der Nacht festigen. Obwohl seine Truppen verkrüppelte Opfer erlitten hatten, beschloss Lee, den ganzen Tag des 18. mit McClellan weiter zu kämpfen und gleichzeitig seinen verwundeten Süden zu entfernen. Nach Einbruch der Dunkelheit befahl Lee den Rückzug seiner angeschlagenen Armee von Nord-Virginia über den Potomac ins Shenandoah-Tal.